Species: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ananas comosus (TPB 2016) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EST ID: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
c89296_g1_i2 (View in GBrowse) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Function: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pentatricopeptide repeat-containing protein At2g13420, mitochondrial OS=Arabidopsis thaliana GN=At2g13420 PE=2 SV=1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Full Length Predict: | Start Codon Status: | Strand and Stop Status: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Full-length | Yes | sense complete | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Domain Search E-Value: | Domain / Pfam ID: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2e-14 | pfam13041, PPR_2, PPR repeat family. This repeat has no known | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Frame: | Start: | End: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 | 34 | 1635 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PEP: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
>c89296_g1_i2 MYRCYRALVTRERTLATRRFLSDSLELGLGFPKPSLPGIEPSPGADTLAALLLRHHNPFHPLESPLELVALGGGAALSPALVVQTLLRLRHASKV ALAFFVSVRDHVHHHRCNGGAQPLLGPAAYDAMVDILGRVRQFDVAWQLIVEMGCGGGGDVGPTPRTFAVLVRRYVAAGMTRQAIRSFDDMEAFV GREPSSAEFQMLLDTLCKYGHAKVATEIFNKRKSKYEPDEKTYSILIYGWCKVNQLEMAQKFLKEMTDRGVEPNIVTYNILLNGICRHASLHPEN RFDRTIRAAEDLLKEMGSRGIEPDVTSYSIILHVYSRAHKPELCLHMFRSMREKGICPTVATYTSVVKCLASCGRLEAAEKLLDEMSSNGVCPSP ATYNCFFKEYRGRNDAEGAMNLYKKMKESGLLSKPDIHTYNILLGMFSKLDRLGTVRELWSDMSESGVGPDLDSYTLLIHGLCEKNKWREACQFF MEMIEKGFLPQKVTFETLYRGLIQADMLRTWRRLKKKVDEESLKFGAEFEHYHFKPYKR |
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Sequence: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
>c89296_g1_i2 agagagagagagagagagctgtgttgctctcccatgtatcgttgctatcgtgcgcttgtgaccagggagcgcacgttagcgacccgacgcttcct ctccgactcactggaattagggttagggtttccgaagccgagcctccccgggatcgagccctcccccggcgccgacacgctcgcggcgctcctcc tccggcaccacaaccccttccacccgctcgagtccccgctcgagctcgtcgccctcggcggcggcgccgccctctcccccgccctcgtcgtccag accctcctccgcctccgccacgcctccaaggtcgccctcgccttcttcgtctccgtccgcgaccacgtccaccaccaccgttgcaatggcggcgc ccaacccctcctcggccccgccgcgtacgacgccatggtcgacatcctcggccgcgtgcgccagttcgacgtcgcgtggcagctcatcgtcgaga tgggctgcggcggcggcggcgatgtggggcccacgccgaggacgttcgcggtgctggtgaggaggtacgtggcggcggggatgacgcggcaggcg atccggtccttcgacgacatggaggcgttcgtcgggagggagccgagctcggcggagttccagatgcttctggacaccctctgcaagtatgggca cgcaaaggttgcaacagagatattcaacaagagaaaatccaagtacgaacccgacgagaagacgtactcgatcttgatttatggatggtgcaagg taaaccagctcgaaatggcccaaaagttcctaaaagaaatgaccgatcgtggggtagaaccgaatatagttacatataacatcctgctgaatggg atttgcaggcacgcgagcttgcacccggaaaatcgcttcgacagaacaatccgtgctgctgaggaccttttgaaggaaatggggtctagggggat tgaacccgatgtgacgagctactctatcattctacatgtttatagccgggcccacaaacccgagctctgtcttcatatgttccggtcaatgagag agaaaggcatttgccccactgtggcgacatacacctcggtagttaaatgtctggcttcttgtgggagattagaagctgcggaaaaattactcgac gaaatgtctagcaatggagtgtgcccatcccccgccacttataattgcttctttaaggagtatagagggagaaatgatgcggaaggcgcaatgaa tttgtacaagaaaatgaaggaatcgggcttgctaagcaagcccgatattcacacgtacaatatattacttggaatgttctcgaagttggatcgat taggaactgttcgggaattgtggagtgatatgagtgagagtggtgttgggccagatttggattcgtacactttgctcatccatgggctttgcgag aagaataagtggagagaagcgtgccagttctttatggagatgatagagaaagggtttctcccgcagaaggttacattcgagactctttatcgagg attgattcaagctgatatgttgaggacttggaggagattgaagaagaaggttgatgaagaatcattgaaatttggtgctgagttcgagcattatc attttaaaccgtataagagatgattttagttgtgggcttgaattttgtaaatacgtgattgggaagatgaggcttttttcttaggctgattttac acggcaaaatgcaaaaagattgaaagcagtttggaagtggtatcataattataggtgctgtaagccatcatgcttaaagatgattcttttgatac aatccaccaactctgcagcttgttatctctatgcgtaggtgctctgggacaggtcagtttgaagaagccctaatagcttttctgttaaaatcatt aaggcatctctcgactgtagctagaagcagaaattccgaagcggctcctgattttgtggctcaaaagctcatgttgcacattcctctccaaccaa aagctctacaccatttgtttggcaaacattcatcttctacttctatagttaagaagctcttctcgaaggcgtgaaaaaagaaggtttgtcaatgc tgtcgttagcaatgtacgtatgttctcttaccaagtgcttgagaaatctttctttaaagtttttcttagtcttactatttatgattgtttcaacc atatatttctatgttttctacgttggttaacaagttaaggtcttttattcgtagttcggtggatatatttttataaatggtttggtgagtgtgag atgctaccaaagaataatatattgtgttgtatctttggactagctcgcttagcttaagcgagcttactaaacaagtaaaatatttgaatcgagc |
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Alignment: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
View alignment | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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CDS / EST BLASTN: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene | e-Value | Identity | G Start | G End | E Start | E End | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Aco019047.1 (View in GBrowse) |
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