Species: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ananas comosus (TPB 2016) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EST ID: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
c89091_g1_i3 (View in GBrowse) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Function: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
- | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Full Length Predict: | Start Codon Status: | Strand and Stop Status: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
- | - | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Domain Search E-Value: | Domain / Pfam ID: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
- | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Frame: | Start: | End: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
-1 | 577 | 951 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PEP: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
>c89091_g1_i3 MQVLINSQLELKLLTSSLNFLVELLNSSAFTNLNFSSNNSQPQHARNSNLLNFNSLLLNLELPKPSLWLGSTPPVEPAGYKVTHYTPQASLLSLF SVLYFFSQLNPFFSAELHRISFLLYFVSFG |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
>c89091_g1_i3 attacatccaacttcttcctctcttttctcttagcctaggagcaagtagtgaggtaccagcctacaaacctgcagcagggttgcaatgtaattat ggagaattagagggttaagttgcaaaatttcatccttatcatctcatccctggtttataacacctggcaaagcaccaggcttcttctctctcacc ctttttcatctctcttcttcccttttccttcagccaaaggaaacgaagtagagaaggaagctaattcggtggagttcagctgagaagaaaggatt cagctgggaaaagaaatagagaactgaaaagagagagagaagtgaagcttgaggagtgtagtgggtaaccttgtagcctgcgggttcaactggag gggttgatccgagccaaagagaaggttttggaagctccagattgagaagcaaggaattgaaattcagcaagtttgaatttcgagcatgttgaggc tgggaattattagagctgaagttcagatttgtaaaagctgatgaattgagaagctcaaccaggaagttgagactggaggtaagcaacttcaattc caattgagagttaattaacacctgcataagaattagacctaaaccataaaaattggtgttaatggataagttagtagagatgaaattggagatgt gttaactctcaattctaaattggagtgatgctgttactcatgtaaaaagctggaagtaagctaattgagtaatagaatagcttagaagcaatgct tcaaattgaattaattagtacttgaatttgtacaggaaattcaagtagataactgagcaaagtatgattgttgctcagattgagagaagaactga aggagcttctctagtatgttgaattgctagaagaatgattaaaacctgaaatctagggcttgggaggtgacttcttgctgctgaggtgctgctga actgaaggagtgtttaaagctgtggagcaggaaactaggggcagaggcactgactggaggtaaattaatatacctactgttcagagtgctgttaa ttgccttgaataaatctgaattacagatgtgaacttagaactttactgctgcaaagaagtttaaggagttgtgtttgtagcaggaaaaattaaga gagtattgggtgctgaaaattcagcatagtgtg |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Alignment: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
View alignment | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Alternative Splices: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome ID: | EST ID 1: | EST ID 2: | Start: | Stop: | Strand: | AS Code: | AS Type: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
LG18 | c89091_g1_i2 | c89091_g1_i3 | 3166063 | 3166182 | - | 1^2-,0 | intron retention | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
LG18 | c89091_g1_i3 | c89091_g1_i5 | 3165701 | 3165944 | - | 1^2-,0 | intron retention | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
scaffold_825 | c89091_g1_i3 | c89091_g1_i5 | 45555 | 45798 | - | 1^2-,0 | intron retention | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
scaffold_825 | c89091_g1_i7 | c89091_g1_i3 | 45555 | 46036 | - | 1^2-,3^4- | complex events | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
LG18 | c89091_g1_i3 | c89091_g1_i4 | 3165701 | 3166112 | - | 1-3^4-,2- | complex events | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
scaffold_825 | c89091_g1_i3 | c89091_g1_i4 | 45555 | 45966 | - | 1-3^4-,2- | complex events | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
LG18 | c89091_g1_i1 | c89091_g1_i3 | 3165490 | 3166182 | - | 1^2-5^6-,3^4- | complex events | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
scaffold_825 | c89091_g1_i3 | c89091_g1_i1 | 45346 | 46036 | - | 1^2-5^6-,3^4- | complex events | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CDS / EST BLASTN: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene | e-Value | Identity | G Start | G End | E Start | E End | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Aco028427.1 (View in GBrowse) |
1e-97 | 98 | 362 | 553 | 49 | 240 |