Species: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ananas comosus (TPB 2016) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EST ID: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
c88107_g1_i1 (View in GBrowse) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Function: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
amino acid permease 7 OS=Arabidopsis thaliana GN=AAP7 PE=1 SV=1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Full Length Predict: | Start Codon Status: | Strand and Stop Status: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Full-length | Yes | sense complete | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Domain Search E-Value: | Domain / Pfam ID: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
4e-49 | pfam01490, Aa_trans, Transmembrane amino acid transporter protein. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Frame: | Start: | End: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2 | 1514 | 2416 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PEP: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
>c88107_g1_i1 MLMFGLVQIVFSQIPDFHNMAWLSILAAIMSFSYSFIGFALGIAKVIGNGRIKGGIGGIHTATPAQKVWRVSQALGDIAFAYPYSIILLEIEDTL KSPPPENQTMKKASMISIFITTFFYLCCGCFGYAAFGDDTPGNLLTGFGFYEPYWLIDFANACIVLHLIGGYQVYSQPVFSFVDRWFSAKFPNNG FVNNFYRIKLPLLPPYRLNLLRLCFRTLYVATTTGLAMFFPYFNQVLGLLGAFNFWPLAIYFPVEMYFIQRKIEPWTKGWIVLQSFSAVCLLVSI FALVGSVEGVLAEKLS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
>c88107_g1_i1 gaggttgtggcttagtaatgagagggacacggagagaattattgggtgggtgggaaaatgagaggccatcttttagctgcagagccaagttgtgt cagaaaaaataatagtaaataataaatattatatgaatcaatcaaaaagaatctggtcccccaatggctcattctaaaatgcctaactttgtctc accctatttacaatttgattggaggattttaagcctcacaaatagttcgaacccgaagctgaacccgaactcgacatacgtaggcgaggagatga atatgtagtcccattgatgtagactcctttccccctttgcttgtacaaaagatgttcgaaacggactcgaaccaaaccgaaaacggaaagagaat tcgactcgctctcatgcggtccaccctcgagccccgcgcaagtcacaattctaagttagagagccaaagatttcaataaggttgatgtttacttc atcccagcctagaccttctctctatattacacacttcattgagaaattggtggtgtctatctacaactctcttcactttgattaagatcataaag gaaatggctgttcaccattctcttgcactcactgatgcttcttgttccgacgatgatcgcgacatgcgaaccgggacaatttggacatgcatagc ccatataattaccgcggtgatcgggtccggcgtgttgtctctcgcgtggagcgtcgcgcaattgggttggatcggaggccccgtttcgatgcttt gctttgccatagtcacctatgtctctgcctttctcctctcagattgctacaggtcccctcaccctgtaaccggggcaagaaacccctcctatatg gatgctgttagggtaaacttaggtaccgcattatttgtaaaagctttttaccgtcacttaagagtctcttcgtcctcgctatagcttctgcaaaa gtgctttgcgtagctgcttgaaaaagtactaacactttttgtcatagtgaaaaaagaagctttcctatttgagcttttggtttaaggatttaaaa gatttttgtcagagaagtcgttccagaagccaggtcaaacaggcatttagtcgaattattcgacgcactattcgaagaatcacatcagatgcgcc gctgtttagtagctgctataacataagtttcatggctattcagggaaaaagcaaacatggttgtgtgggctacttcaatacttgagcatgtatgg gactggtattgcatatacaatcacaacttcaactagtatgaggtacactgaatataccacttgttcaaacagcaagaacaactcctaaaaatata acaaaactcaccaccaaattgttagcataagtgcttaactttgcgcatgagtttcaaattgatagaagcaatttatttcgtagtaattcgtatga attatgaacctgcagggcaattaagaaatcagactgctaccacaaagaagggcacgaagcgccgtgcgcgtacggagataacttctacatgctca tgtttggacttgttcagatagtcttctcgcagataccggatttccacaacatggcgtggctctctattctcgccgcgatcatgtcgttctcttat tccttcatcggattcgcactcgggatcgccaaagtcatcggtaatggaagaatcaaagggggcatcggagggattcatacggcaactccagctca gaaagtgtggagagtttctcaagcactcggagacatcgcattcgcctatccgtactccataatcctcctcgagatagaggacacactaaagtcgc caccgcccgaaaaccaaactatgaagaaagcatcgatgatctccatttttatcaccacattcttctacctttgttgtgggtgcttcggctatgcc gcatttggggatgacacaccggggaaccttctaactggattcgggttctacgagccgtattggcttatcgactttgctaatgcatgcattgttct tcatcttatcggtggttatcaggtctatagccaaccggtgttctcattcgtagacagatggttctcagcgaagttccccaataatggatttgtga ataacttctacagaataaaattaccacttctaccaccttatagattgaatctgctgaggctctgcttcagaaccttgtatgttgcaaccacaaca gggcttgccatgttctttccttacttcaaccaagtgttgggtttgttgggggccttcaatttttggccattggctatttacttccctgtggagat gtacttcatacagagaaagattgaaccatggacaaaggggtggattgtattgcagagttttagtgctgtgtgcctccttgttagcatatttgctc tggttggctcagtggaaggagttttagctgagaaactaagttagaaggaaccattttgcataaaattttctttccttccccctctttttttttgt gtgagtgatgagaagtgaaaggtaagaagagccaggaatcatagggttggtggtgaatgaaaggcttacagatgtaatcagctctttctgtacat ttttctcagaaagaaaatcaaggaaatcggaagttctatacatgtaatgtaatataccatgtacatcccttttttttttttggtttaatgggaaa atatctagtttgtacattcatgtcatggtaagtgtgataccaagggacaaaagttggctgttctctatctaaacagttcaagcattta |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Alignment: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
View alignment | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Alternative Splices: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome ID: | EST ID 1: | EST ID 2: | Start: | Stop: | Strand: | AS Code: | AS Type: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
LG20 | c88107_g1_i1 | c88107_g1_i6 | 10441669 | 10441871 | - | 1^2-,0 | intron retention | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
LG20 | c88107_g1_i1 | c88107_g1_i7 | 10442740 | 10442904 | - | 1^2-,0 | intron retention | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CDS / EST BLASTN: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene | e-Value | Identity | G Start | G End | E Start | E End | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Aco015309.1 (View in GBrowse) |
0.0 | 98 | 1439 | 2419 | 397 | 1383 |