Species: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ananas comosus (TPB 2016) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EST ID: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
c86380_g2_i5 (View in GBrowse) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Function: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
- | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Full Length Predict: | Start Codon Status: | Strand and Stop Status: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
- | - | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Domain Search E-Value: | Domain / Pfam ID: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
- | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Frame: | Start: | End: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 | 1024 | 1335 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PEP: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
>c86380_g2_i5 MEKSRGDWRVIFSSSGAMQTTRLLPFRSRRSGASMPTALNPLPRASRRPPPIFATTAGDGPASEGADRQHEYAMQRRCPNFFYFPFYLPFSFVYF EHAETTTRE |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
>c86380_g2_i5 tttgcctctataagagaagtgttcaagtggtggttcatatttatcagtttcctccttcaaccttttgtggtttctatacttctctgagctttgca ctactctggggctttccttttcttgtgagatttattctatagtgctagatcactgaaagtcttgttggttcttatggcactacctggaagacgtg ccgataggatagatcattctatccctagaagtaatcattggagcctcacacgtggaggaaaaagaattcttcgctattttgacaaacaaatactt taaaagacatttctactaaaagaattgaattatctccaacacaagcttcaatgaaccctgcagccgtttcacgcactgcatatcttatcaacaac accgaccctctagcaactttgcatgtagctggctgaagatcaatcaaagaggcaaccaatagttttcctatgtaatgctcttaatatccctctaa aagtcccctggataccgcccgaatttatcgacgccttccatgcctgcatgcaacggcatcagcagccttaaagttcacttctagttgttagtata actcacttttatatttgacaattgacaagcacaacaatggactaaggagttgctgaatttgtacttccaaacaacataaggcagttgtgtaaagc atcaaattatctctcatgaccaagaggaccaatatattaagcgagaatgttgtttgtacacaaggtacagtaatcagaattctgttgggcgcacc ttgaatggcaaacaatatgaagatcatccgaaacaagtgaaaagggacaggcgaaaagaacatgtcgaattcaattcatgagatcatcatagctc accatcactatagtctggaaaagtgacacacttgaagactttgcacttttgacatataacgtatccaacagctttacaagttgggcaacggcgat aaatccggttgttctccgccttcacataagtcttctttccttcacaaaaatcgcacagcaaccatcctctacgatggagaaatcgagaggggatt ggcgggtcatcttctcctcctccggcgccatgcagaccacgagacttcttccattccgatcccgccggagcggagcgagcatgccaacggcgcta aatcccctcccgcgtgcgtcacggcggccacctccgatcttcgccaccaccgccggtgatggtccggcgagcgagggtgccgacaggcaacacga atacgccatgcaacgccgatgccctaatttcttttattttccgttttatcttcccttttcgtttgtgtacttcgagcacgcagaaactacgacaa gagagtgatttttttatatatataattcttcttcttcttctctctcttgtttcgtgaggcggcgaagaccacaacaacccgcttcgccaccgcct ctcgtagatcaactgaagttggggatttgggaacaggagaatttgccgaggcctccgcgtcggtacaaggattggagaaatctacctcggtgtat atactacaccatggagatctaacggctgatattta |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Alignment: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
View alignment | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Alternative Splices: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome ID: | EST ID 1: | EST ID 2: | Start: | Stop: | Strand: | AS Code: | AS Type: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
LG20 | c86380_g2_i5 | c86380_g2_i7 | 6420130 | 6420372 | + | 1^2-,0 | intron retention | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
LG20 | c86380_g2_i5 | c86380_g2_i7 | 6419729 | 6419760 | + | 1-,2- | alternative acceptor site | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CDS / EST BLASTN: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene | e-Value | Identity | G Start | G End | E Start | E End | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Aco018202.1 (View in GBrowse) |
e-123 | 100 | 1022 | 1244 | 223 | 1 |