Species: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ananas comosus (TPB 2016) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EST ID: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
c81482_g1_i1 (View in GBrowse) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Function: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Exocyst complex component EXO70A1 OS=Arabidopsis thaliana GN=EXO70A1 PE=1 SV=1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Full Length Predict: | Start Codon Status: | Strand and Stop Status: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Short (49) full-leng | Yes | sense complete | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Domain Search E-Value: | Domain / Pfam ID: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2e-57 | pfam03081, Exo70, Exo70 exocyst complex subunit. The Exo70 protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Frame: | Start: | End: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2 | 23 | 1480 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PEP: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Sequence: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
>c81482_g1_i1 cctctccgccctcgatgccgccatgcgccccacccaagtgaggacgcacgcgatccggatggcgcacgagaacatcgacaagacgctcaaggccg cggaggtgatcctcgcgcagttcgatctcgcgcgccaggccgaggctacgatactaaggggtccacatgaggatctagaaagctatctagcagct attgacgtattgaagagcattgtccattattttacctcaaataagaacttaaagagcagtgatggagttctgaaccatgtcaacaacttgctagc caagtctgtagtcaagttggaggaggaattcgggcagctcttagcttcttacagcaaacctattgagcctgatcgtctatttaattgccttccca actatttgcgaccgtcagcagtggaccaacgtgaaaatggtaagaaccatcgctccgagcattctgccaaaagctcggagggcgctgtttataaa cctccaactctcattcctccacgcattttacctctgctgcatgacttagcccatcaattagttcaagctgggcaccaacagcagtgcttcaaaat atacagcaatgctcgtgctgcagcattagaatcaagcctccggaaactgggtgtggaaaaactcagtaaagaagatgttcagaagatgcagtggg aggctttagaggccaaaattgggaattgggtccacttcatgcgaattgctgtcaaactgctctttgctggagaacgaaaagtttgtgaccagatt tttgatggtataaagattcccaaggaccaatgctttggcgaagtgacaatgaacagtgtagaaactcttctaagctttggtgatgcagttgctaa aagcaaaaggtccccagaaaagttgtttgtgctgctagacatgtatgaaattatgcatgaactacagccagagtttgagacgatcttcgagggca aagcttgtattgagatgcgcgaatctgtagtgagtttgactaaacggttggcacagactgcgcaagaaacatttggtgactttgaagagctagtt gaaaaggatgcttcaaaaacaactgttcttgatggaaccgtccatccacttactagctacgttattaactatgtgaagttcttatttgattatca gtcaacattgaagcaactattcatggagtttgaaactgggagtgaaacagtgtctcaactggcgatagttacaacaaggattatgcaggctcttc agaataacctagacggaaaatctaagctgtacagagatccggctttgacttacctgtttcttatgaacaacacccattatatggttagatctgtg cggaggtgtgtgtattactattttgcatctgactttaatagggttttaattttattttttttattttttttggaaatataccattcaaaatcgag aaaactgcaaaatttaaccttcaaagttggtatctgcatgtgtgcccagcaaaactgagtgaatttattttgcattagtatccctgctgggggca cgcatgcaaaagctgtttttgcatggaggggcatacatgcaaataccaacttttgccaaaaacacaacaaaatatggaactttcccagggacact tggtatgtatatgtttccaggtcagaagcaaaggacatactgggtgatgactggatccaaagacatcgaaggatcgttcaacaaaatgcaaatca gtatagaaggattgcttggagcaagattctccagactctttctgttcaaggtatgaactccagcgcctctatggcaactgatggaggtaacagca gtggagtttcaagagcggcaatcaaagagcggtccacacttcatctcacatattattatcatttttttattttgcc |
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Alignment: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
View alignment | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Genome ID: | EST ID 1: | EST ID 2: | Start: | Stop: | Strand: | AS Code: | AS Type: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
LG20 | c81482_g1_i1 | c81482_g1_i4 | 2500805 | 2501106 | + | 1^2-,0 | intron retention | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CDS / EST BLASTN: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene | e-Value | Identity | G Start | G End | E Start | E End | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Aco023866.1 (View in GBrowse) |
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