Species: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ananas comosus (TPB 2016) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EST ID: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
c80788_g1_i3 (View in GBrowse) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Function: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Homologous to Calmodulin-binding receptor-like cytoplasmic kinase 3 OS=Arabidopsis thaliana GN=CRCK3 PE=2 SV=1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Full Length Predict: | Start Codon Status: | Strand and Stop Status: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Full-length | Yes | antisense complete | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Domain Search E-Value: | Domain / Pfam ID: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
4e-23 | pfam07714, Pkinase_Tyr, Protein tyrosine kinase. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Frame: | Start: | End: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
-1 | 631 | 1317 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PEP: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Sequence: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
>c80788_g1_i3 tctctctctctctctcttttgcttataggttatgtgcaagagtacgtcatattctgaaatttcacctgcataaaggtggagataagtcagtccat gagcaacatcaatggctatttccagccgttggctgaagtccagaatcctcccatgctgaccatctaaatgctccctaagagtgccatttggaaca tactcggtaatgataattcgttcacttttattttcaacgtaaccaagtaatttgactaagttcctatgttcgattttggtgagcagtgcaacttc atttctaaattcctcatgtaaagcagcaaagtgttccttttttgcccttttaatagcaataggcctcccatcaggaaggtcagctttgtaaacag ttccaaagccaccgtcgcctattacttttgcaggtgaaaaattatgagtaattttaataatctgattgatgctcagatgcagtggcccaatagca gttggttgttgagacaatgaaaatctagaaggacttggaggcactcgcagtggagttccaggaattctatcagaagatgatctcagttcagaaga atccattgaattcatatctctggctaaaaccggatcctcacttatatccgtccttttcgatccaaagcaaggacaaatgaaggtaaatacaagaa acattcctggagtagctagcataacatgatctgactccagtgtgcaactatgatattttcacttttagcctttttgtagcttttcctttaagtta gttcatgaaagataagcagaaagtcctcttctataccattaagcacgtcctctcagaaatggacgcacatcaccggcgaagaacacaaatcacca gatccttccctaattcttctccgaatcacaagtgaaacgacacccactgtacaatcccaactcaatctccggcatcaaacccacatcactacagc aatcgctataatcggaactaaatagcgaatacccaaagaccaaattcaccaaattcgccaaatttcgggggaaaaaccagcaaaaccctagaaga aacaatctaaaccctagaaaactcaatccgagctcaaattaatcacctgtaaaagctccaattccttgattaacacaaaatccccctttaataag cttcagatacgatctttatactacaagaaccatcttcggggattcgaagatagagagagagatatgtgatgtgtacgattgattgaaaaaggtgg agtttgcgtttataacaatggcgacgtaggcaagtgcgcgaatttgaccattggggagggtcggaggagacttgtgttgact |
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Alignment: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
View alignment | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Alternative Splices: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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LG20 | c80788_g1_i3 | c80788_g1_i1 | 7580661 | 7580914 | + | 1-2^,0 | exon skipping | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CDS / EST BLASTN: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene | e-Value | Identity | G Start | G End | E Start | E End | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Aco018917.1 (View in GBrowse) |
0.0 | 99 | 66 | 687 | 622 | 1 |