Species: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ananas comosus (TPB 2016) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EST ID: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
c79516_g1_i1 (View in GBrowse) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Function: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
protein phosphatase 2C 59 OS=Arabidopsis thaliana GN=WIN2 PE=1 SV=1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Full Length Predict: | Start Codon Status: | Strand and Stop Status: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Full-length | Yes | sense complete | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Domain Search E-Value: | Domain / Pfam ID: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
4e-58 | pfam00481, PP2C, Protein phosphatase 2C. Protein phosphatase 2C is | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Frame: | Start: | End: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2 | 305 | 1156 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PEP: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
>c79516_g1_i1 MGYWSSVVGNQSDGSPVSGGGLSQHEKFSYGYASSPGKRSSMEDFYETRIDGVDGEIVGLFGVFDGHGGARAAEYVKQHLFSNLIKQPKFISDTK SAIASAYSETDLEFLKSENNENRDAGSTASTAVLVGDRLLVANVGDSRAVICRGGNAIAVSRDHKPDQTDERQRIEDAGGFVMWAGTWRVGGVLA VSRAFGDRLLKQYVVADPEIKEEVIDGSLEFLILASDGLWDVVSNEEAVAIVRPIEDPEQAAKKLLQEAYQRGSADNITCVVVRFLSGQDSDAK |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
>c79516_g1_i1 aaaaaaaaaaaaatccaacggtctctctcgctccctgcccctctgcccccctgcccctctcccccttcatttctcctcctctcaccaccaccata caccagacccacaaatccgttgttggtttcgtcctcctcctgcgctgcgctcggtttgggtttgtttcccatctcctcctatttcaaagaatcct cttccataatcagaatcaatttcgcttccttcgacagggtcgttcgactttgatctacaactgggcgacgaggccgccaaaacgagcgagaaaag agaagggattggcgattcgatgggttattggagttccgttgttgggaaccaatcggatgggtcccccgttagcggcggagggctcagtcaacatg agaaattcagttatggctatgcaagttctccagggaaaaggtcttccatggaggacttttatgagacaagaattgatggcgtcgatggagagatt gtcggcttgtttggagtctttgatggtcatggtggtgctagagctgcagaatacgtcaagcagcaccttttcagcaatttaattaagcagccaaa attcattagtgataccaagtcagctatagcttctgcatacagcgagactgatttagaatttctgaaatctgaaaataatgaaaaccgagatgctg gatcaactgcttcaactgctgtccttgttggcgaccgtttgctagttgctaatgttggggactctagggctgttatatgcaggggagggaatgct atagctgtctcgagagatcacaagcctgaccaaactgatgagcgacaaaggattgaggatgctggaggttttgtgatgtgggctggaacatggcg tgtcggcggtgttctcgctgtatctcgcgctttcggtgataggctcctgaagcagtatgttgttgctgatccagagattaaggaagaagtgatcg atgggtctctcgagtttctcattcttgcaagtgacgggctatgggatgttgtctcgaacgaggaggctgttgccattgtcagaccgatagaagac ccagaacaggcagcaaagaagctcttgcaagaggcttatcaaagaggaagcgcagataacatcacttgtgttgtcgtgcgtttcttatccggaca ggatagcgatgccaagtagaaagatggagaaaaggttactttcttgttacaatggaagcttctctgcatgtccctgcaatcaatgtaaagatagt atctgaaaaagtcaaataaaaagaactgcttatggagaaagcacttttcgactgatggaatatgttgtttacatttccagcctctaataggaact agtagaagatagtaaatgtatgatgtaccggtctgtattctgtaaggactaatggatctaatgtctaatgctagaagaaatcaatttattttcct gctatgctttgtaggctatatattacgctttttctccttgaactatgaggtgagtgataccttgattctcaaatttaattcattgtaatttttgg tcgatttgttagatcgttaaaaa |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Alignment: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
View alignment | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Alternative Splices: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome ID: | EST ID 1: | EST ID 2: | Start: | Stop: | Strand: | AS Code: | AS Type: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
LG20 | c79516_g1_i1 | Ac2284 | 4554653 | 4555132 | + | 1^2-,0 | intron retention | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
LG20 | c79516_g1_i1 | JI407009.1 | 4549323 | 4549397 | + | 1^2-,0 | intron retention | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
LG20 | c79516_g1_i1 | c64825_g1_i1 | 4555223 | 4555547 | + | 1^2-,0 | intron retention | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CDS / EST BLASTN: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene | e-Value | Identity | G Start | G End | E Start | E End | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Aco023383.1 (View in GBrowse) |
0.0 | 99 | 227 | 1159 | 106 | 1038 |