Species: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ananas comosus (TPB 2016) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EST ID: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
c79122_g1_i5 (View in GBrowse) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Function: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Homologous to Protein MITOFERRINLIKE 1, chloroplastic OS=Arabidopsis thaliana GN=MFL1 PE=2 SV=1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Full Length Predict: | Start Codon Status: | Strand and Stop Status: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Partial | No | sense complete | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Domain Search E-Value: | Domain / Pfam ID: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
7e-16 | pfam00153, Mito_carr, Mitochondrial carrier protein. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Frame: | Start: | End: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 | 1 | 990 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PEP: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
>c79122_g1_i5 PPPNSLTPPPSLSSLSLSSSSKPSSSSERSLLSPLDRAAIGALAGAFAGGLTYVALLPLDAVKTRLQTLPSSSASASSAVAAASSILRSHGPLGF YRGLSAVLLGSAASSALYFATCELAKSLLHTLTLTLNPFFVPPLAGALGNVVSSAVMVPKELLTQRMQAGAGAHRRTLDLALHILREDGVFGLYA GYAATLLRNLPAGILSYSSFEYLKAFALRLTKKPHLEPAHSVACGALAGAISASLTTPLDVVKTRLMTQPQGEGSRKVFETMRQIVLEEGWAGLG RGIGPRVLHSACFAAIGYCAFETARLAILQWYIQQREKAMVKSAA |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
>c79122_g1_i5 cccccccccaattccctaacaccccccccatccttatcctccctctccctctcctcctcctccaaaccctcctcctcctccgaacgctccctcct ctccccgctcgaccgcgccgccatcggcgccctcgccggcgccttcgccggcgggctcacctacgtcgccctcctcccgctggacgccgtcaaga cccgcctccaaaccctgccctcgtcctccgcctccgcctcctccgctgtcgccgccgcctcctccatcctccgctcccacggccccctcggcttc taccgcggcctctccgccgtcctcctcggctccgccgcctcctccgccctctacttcgccacctgcgagctcgccaaatccctcctccataccct aaccctaaccctcaaccccttcttcgtcccgcccctcgccggcgccctcggcaacgtcgtctcctccgccgtcatggtccccaaggagctcctca cccagcgcatgcaggccggcgccggcgcccaccgccgcaccctcgacctcgccctccacatcctccgcgaggacggcgtcttcggcctctacgcc gggtacgccgccaccctcctccgcaacctccccgccgggatcctcagctactcctccttcgagtacctcaaggccttcgcgctgcgcctcaccaa gaagccccacctcgagcccgcgcacagcgtcgcctgcggcgccctcgccggcgccatctccgcctcgctcaccaccccgctcgacgtcgtcaaga cccgcctcatgacccagcctcagggtgagggcagcaggaaggtgtttgagactatgaggcagattgttctggaagaagggtgggctgggctgggc cgagggattggcccgagggttttacatagtgcatgctttgcggctattggttactgtgcatttgagacagccaggctggcaatattgcagtggta tatacagcagagggagaaggccatggttaaaagtgcagcttaagttagcagctgcagaataatctatacaatagacaaagaggacctggagctgg gaatctaaagaagggctatgaacattcacatgcggtttgttcctttttactgtgttgtatgtttagtccctctattatgccgatattgtgccctg atctctggatttatggcttgaacatttagtccctaaaatttcgcatatattgcgctttagttcctaacagtcaaaaagtaatctatcttatcctt ataacaaaaatcagtttaactcttttacctgtaaaagggttctcatacttcaaattacatcaaatagagttaaaaggtcattttacgatagaagt gcgtttttcgtttcttttcttttttgccctctaaaggtcaagaactaaacagcaatatatgcgaaagtttaagaactgaagtgctgaagtgaaaa gtagtgaggaccaagctgccgcatcaagactgtgcaaggactaatatacattttgcccttcctttttagtcacaagagtgaagaatggtgcttca ccaatccaagccaaagaagaaatggaggagactctgctctttctattttctttttcccttattttttttcctaaattttctttgtttaactcctt ttgtgtttccagatgagaaagattgattcattattgtgggcatttaatttcgtcttatttacatctatctccctcttgtttgtaataatctttca ggcctggttggatgcattaacatcttattcgaagtatttgcgcgatg |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Alignment: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
View alignment | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Alternative Splices: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome ID: | EST ID 1: | EST ID 2: | Start: | Stop: | Strand: | AS Code: | AS Type: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
LG20 | c79122_g1_i5 | c79122_g1_i4 | 2341507 | 2341924 | + | 1^2-,0 | intron retention | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CDS / EST BLASTN: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene | e-Value | Identity | G Start | G End | E Start | E End | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Aco024150.1 (View in GBrowse) |
0.0 | 99 | 51 | 993 | 112 | 1053 |