Species: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ananas comosus (TPB 2016) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EST ID: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
c74204_g1_i2 (View in GBrowse) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Function: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Filament-like plant protein 7 OS=Arabidopsis thaliana GN=FPP7 PE=3 SV=2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Full Length Predict: | Start Codon Status: | Strand and Stop Status: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Full-length | Yes | sense complete | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Domain Search E-Value: | Domain / Pfam ID: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
e-127 | pfam05911, DUF869, Plant protein of unknown function (DUF869). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Frame: | Start: | End: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3 | 63 | 3233 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PEP: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
>c74204_g1_i2 MEQKTWLWRRKSSEKNVLEKSDLLAKEQEKERALKLERSVQDLNEQLSSARTESDAKDDLLAKQAKVAEEAITGWERAETEALSFKQILDDALQQ KEVMEEKIDKLDVALKDCHQQLNVSKEEKEHIINEAAKKISKEQEKLRTLEQKLAETNKKIASLGDENSNLCTIVEMKERLIEELNESKALVEAN LAEVSKRLDLTEKGNASLKYEVCMLQKELEIRTEERGYNIKSADAAHKQQLESVKKIAKLEAECQRLRVMVRKRLPGPAALAKMRSEVELLGHDN YMELRSKSANSPKSFASRGFVSENGYEAASLLERLRASEDENKILRESLTKKTSEIEHTSSRLSQIERQLKDLSKGHDCYDHIKSSPRMYEHPLA SISEGGGHGDNVSCAESWASALISELEHFRNGKPTTPSSRSIGMSDLSLMDDFVEMEKLAVTYVDNRTLLSAQLPSRDSRSCVTTTARSDFTEEA GKELIPVENLSGYITLENYPSWLQDILRVIIQKHHITQKSIDAIFEDVRSALQKQDLFIRGNSSNALNANGNTPRKPQSASLDSFEGIVDTSASH TETANQLSKSNIEKVVSKLIEQVEGIIRRCKKNNDGQLTVSGSDTVSPKSGALNGYVARAFLWETSELTTVLRHFILVCNNLLYGKADPERFISE VSSTLDWIINHCFSLQDVSDMRESIIKHFGGDENCINEFRAVPNSPSLGKNKLDDHDEIKIKGDKIMPLFYTPNGLCSLFEMDIIESRVKESATN RAIPNIELRRSYCEEKIENGNSGNEAPITQVPESEQRTSNFRAEPEAVKESKLIDENHKLEYTAVKVELNETRKRFSSLKVEVENEISTSESEAV AASKGSPKHIIGQEENQLRTSSEIALASEKLAECQETILNLGKQLKALASPKDAALLEKVMLSPTTARPNRRLQLLDHMLAEDGANFEDPNFPQT KEIICTEPRNQQDSTAENPKPGSLNGRNVHTDDNRISNGSVQATTHPVIANKHTHEGDVEMLALVPKTQRGGTSLLRKLLLRKKESKNTKKLTLP ISSFEGKELKGV |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
>c74204_g1_i2 aaaaaagaaagaaaaaagaaaagattgtttacagctcgaacagagaaagttagaagagcagcatggaacaaaagacatggctttggaggaggaaa tcgtcagaaaagaatgtcctcgaaaaatctgatctcttagcaaaggagcaggagaaagagagggctttaaaattagagagatccgtacaagactt aaatgagcagttgtcgtcagctcgcactgagtccgatgcaaaagatgatcttttagccaagcaagcaaaagtggccgaggaagccatcacaggtt gggaaagggccgaaacagaagcattatctttcaagcaaatacttgatgatgctttacagcaaaaggaagttatggaagaaaaaatagacaagcta gatgtagctctaaaagattgccatcaacagttgaatgtctctaaggaagagaaggagcacataataaatgaagctgcaaagaaaatatccaaaga acaagaaaaactacgaactctcgaacagaagctcgccgagacaaacaagaagattgctagtttaggtgatgaaaatagtaatctctgtacgattg ttgagatgaaagaaaggttaatcgaagaactaaacgaatcaaaagcactcgttgaagcaaatttagctgaagtatcaaaaagacttgatttaacg gaaaaaggcaatgcctctcttaagtatgaggtttgcatgcttcagaaggagctggagattcggaccgaggaaaggggatataacattaaatcagc cgatgctgctcacaaacagcagctagaaagcgtaaaaaagattgcaaagctagaagcagagtgccaaagattgcgcgtgatggtccggaagcgac taccaggccctgccgctttagctaaaatgagaagtgaggttgaacttcttggtcatgacaattatatggaactgaggagtaaaagtgcaaattcc ccaaaatcttttgcatcacgtgggtttgtatcagaaaacggttatgaagcagcttctcttcttgagaggttgagggcaagcgaagatgaaaacaa aattctcagagaatcattgactaagaagaccagtgaaatcgagcatacatcgtccagactttcgcagattgagagacagctgaaggacttatcga agggacatgattgctatgatcacataaaaagtagtcctagaatgtacgaacaccctcttgcatcaatttccgagggtggtggtcatggagataat gtaagttgcgctgaatcatgggcttctgctttgatttccgagctggagcacttcaggaatggaaagccaacgacaccatcttctaggagtattgg catgtccgacttaagtttgatggatgattttgtggagatggaaaagttagcagtgacatatgttgataatagaactttattatctgcgcaacttc cttcaagggacagtagatcatgtgttaccactactgcaagatctgatttcacggaagaagcaggtaaagagctcatccccgttgagaatctctct ggatacataacacttgagaattatcctagttggcttcaggatattttaagagtgattattcagaagcatcatattacacagaaaagtatagatgc cattttcgaagatgtccgaagtgcactgcaaaagcaggatctttttattagaggaaactcctcaaatgccttaaatgctaatggcaatactccta ggaaaccccaatctgcttctttggattcatttgaaggaatagttgataccagtgcctcacataccgaaacagctaaccagctttccaaatcaaac atagaaaaggtggtatctaagttaattgagcaggtagaaggaatcattcgaaggtgcaaaaagaacaatgatggccaacttacggtatctggaag tgatacagtaagtccaaaatctggagctttaaatggatatgtcgctcgtgcatttttgtgggaaacttctgaacttacaactgtcttacgacact ttatccttgtttgtaacaatctgttatatggaaaggctgatcctgaaagattcattagtgaagtaagttcgaccctagactggattatcaatcac tgcttttccctacaagatgtgtctgatatgcgagaaagtatcataaagcattttgggggggatgagaattgcattaatgagttcagagctgtgcc gaacagcccaagcttgggtaaaaataaattagatgaccatgatgagatcaagataaaaggggataagataatgcctttattttatacgccaaatg gcctttgtagtttgttcgaaatggacattattgaatctagggttaaagaaagtgcaacaaaccgtgcgattcctaatatagaattacgaagaagt tattgtgaggagaagattgaaaatggaaattctgggaatgaagcaccaattactcaagtcccggagtcagaacaaagaacatcaaatttccgagc agaacctgaagcagtgaaggaatcaaagttaattgatgaaaatcataaattagagtatacagctgttaaggtcgaactaaacgagactcgtaaaa ggttctcatccctgaaagttgaagtggaaaatgaaatttcaacttcagaaagtgaagctgttgctgcttctaaagggagtcccaaacatattatt ggccaagaggaaaatcaacttagaactagttcagaaattgctttggcatcagagaaacttgcagagtgccaggaaacaatcctaaacctcgggaa acaattgaaagccttggcatctcccaaagatgcagcccttcttgagaaggttatgttgagcccgactaccgccagaccaaatcgtaggcttcagt tactcgatcacatgctagcggaggatggtgccaacttcgaggatcccaacttccctcaaactaaggaaatcatatgtaccgaaccacgaaatcag caagattccactgctgagaatcccaaaccaggatcgctaaatggccgaaatgtccacacagatgacaaccgcatcagcaacggttcggtacaagc tacaacacatccagtaatagctaataagcacacacatgagggtgatgtggaaatgcttgcgctcgttccgaagacacaaagagggggaacaagtt tgcttagaaagcttttattgaggaaaaaggagagcaagaatactaagaagctaacactgcccatcagctctttcgagggcaaagagttaaaaggt gtttaaagaatgggagaaaagtaatgcaaaatttagcatctaggttgggtgctttattgttatcttgcatggttatgggtgagagaagataacat ggtagtgtgtctgagagtgagtttttgtgtaatttctcttctgattgtaatgtaaatctttccttttgttttgtttcttgtaaattgggatctct gttgactctgtagccattcagttgattacagttcttgaagttgtcgagttcggagaagctacatatttagaccttgtttgatattgttgctttgt t |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Alignment: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
View alignment | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Alternative Splices: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome ID: | EST ID 1: | EST ID 2: | Start: | Stop: | Strand: | AS Code: | AS Type: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
LG20 | c74204_g1_i2 | c74204_g1_i1 | 7312502 | 7312579 | + | 1^2-,0 | intron retention | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CDS / EST BLASTN: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene | e-Value | Identity | G Start | G End | E Start | E End | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Aco018901.1 (View in GBrowse) |
0.0 | 99 | 63 | 3236 | 1 | 3174 |